Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms