Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms