Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms