Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms