Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Timm44O35857 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Timm44O35857 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timm44O35857 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms