Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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