Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KeraO35367 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KeraO35367 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KeraO35367 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KeraO35367 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KeraO35367 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KeraO35367 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KeraO35367 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KeraO35367 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KeraO35367 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms