Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms