Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cnih2O35089 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih2O35089 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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