Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgisO35074 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms