Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif1cO35071 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif1cO35071 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms