Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms