Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8857L7N291 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms