Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms