Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 2610017A05Rik-201ENSMUST00000204670 1661 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms