Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms