Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms