Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21972J3QN38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms