Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6176J3QK59 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6176J3QK59 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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