Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200cJ3QK46 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200cJ3QK46 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms