Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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