Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms