Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pabpc4lG5E8X2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms