Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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