Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SprtnG3X912 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms