Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd5G3UW60 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms