Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms