Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5218F6YH22 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5218F6YH22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms