Protein–RNA interactions for Protein: F6Y2A6

Gm5689, Predicted gene 5689, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5689F6Y2A6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5689F6Y2A6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5689F6Y2A6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms