Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17093F6XGJ4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms