Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms