Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms