Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd7E9Q9W7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd7E9Q9W7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd7E9Q9W7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd7E9Q9W7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd7E9Q9W7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd7E9Q9W7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms