Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17lbE9Q9U0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp17lbE9Q9U0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms