Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms