Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb3E9Q7U0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb3E9Q7U0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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