Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdhr2E9Q7P9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms