Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgef5E9Q7D5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms