Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde8bE9Q4S1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Pde8bE9Q4S1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Pde8bE9Q4S1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Pde8bE9Q4S1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Pde8bE9Q4S1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Pde8bE9Q4S1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Pde8bE9Q4S1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde8bE9Q4S1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms