Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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