Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430401F13RikE9Q328 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms