Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr17E9Q271 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr17E9Q271 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr17E9Q271 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms