Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ccdc171E9Q1U1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ccdc171E9Q1U1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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