Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930426L09RikE9Q0N7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms