Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms