Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms