Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf11E9PZM7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms