Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rsph10bE9PYQ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms