Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl3lE9PWZ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms