Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Triml2E9PW10 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms